一、申报领域问题

企业选择申报的技术领域与企业主营业务不对应。在选择技术领域时企业的主营业务（产品）不属于《国家重点支持的高新技术领域》。

二、知识产权问题

(1) 知识产权模块只有申报当年授权的二类知识产权（实用新型专利、软件著作权）或集中大批量申请知识产权，特别是Ⅱ类知识产权都是软件著作权，这类支撑力度小，会被质疑真实性，专家评审时可能不会认可。

(2) 知识产权经过授权之后，缺乏研发过程文件的支撑，直接应用于生产或者形成销售合同，技术的先进性程度会被质疑，认为不能支撑申报上一年度的高新技术产品（服务）收入。